En pharmacologie, les Biopuces constituent une révolution technologique en plein essor mais surtout un nouveau moyen pour soutenir et optimiser les activités de recherche.

Les puces à protéines sont utilisées pour l'analyse des niveaux d'expression des protéines après traitement, dans le but de déterminer l'efficacité et la toxicité potentielles des médicaments testés (screening). Les résultats obtenus permettent alors de déterminer le(s) médicament(s) le(s) plus adéquat(s) et d'identifier les biomarqueurs protéiques caractéristiques des différents stades de la maladie.

Les Biopuces sont également très utilisées en pharmacogénomique. Cette spécialité consiste à déterminer la carte personnalisée des SNP’s du patient pour une caractérisation optimale de la pathologie ce qui permet alors de proposer un traitement adapté (ciblé) via des médicaments «génétiquement optimisés».